Archive - Apr 6, 2006

Genom des Stickstoffproduzenten Anammox aufgeklärt

Ein europäisches Forscherkonsortium hat das - überraschend große - Erbgut des Einzellers Anammox, das die Mikrobe zu einem der wichtigsten Lieferanten von Stickstoff in der Atmosphäre macht, aufgeklärt. Genom des Stickstoffproduzenten Anammox aufgeklärt <% image name="Genaktivitaet" %><p> Für das Projekt mussten 260 Mio Nukleotide sequenziert werden. Um die rund 5.000 Gene aus den großen Datenmengen auslesen und identifizieren zu können, entwickelte das GSF-Institut für Bioinformatik in Neuherberg bei München eine spezielle Software. Die Analyse der Genfunktionen erfolgte in Neuherberg und Weihenstephan. Das Bakterium Anammox wurde erst vor rund 10 Jahren entdeckt. Sein Name ist gleichzeitig Programm und steht für Anaerobe Ammonium Oxidation: Der Einzeller baut in sauerstoffarmen Umgebungen Ammonium und Nitrit zu gasförmigem Stickstoff ab. Anammox-Bakterien sind für mehr als die Hälfte des Abbaus nährstoffreicher Stickstoffverbindungen in den Ozeanen und die Freisetzung als Stickstoffgas in die Atmosphäre verantwortlich. Anammox ist nicht kultivierbar, daher musste die Sequenz aus einer Mischung von verschiedener Genome rekonstruiert werden.

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